1989年3月6日国务院批转劳动部、财政部、国家计委《关于进一步改进和完善企业工资总额同经济效益挂钩意见的通知》对企业实行工资总额同经济效益挂钩作了进一步改进和完善。根据国务院的通知，就有关缴纳国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金问题具体规定如下：
　　一、1988年10月1日以前经国务院或劳动部、财政部批准实行“总挂总提”奖金进成本的挂钩企业，其由成本开支的奖金部分免征国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金。
　　二、1988年10月1日以前未经国务院或劳动部、财政部批准，但已实行“总挂总提”奖金进成本的挂钩企业，其由成本开支的奖金，应从挂钩之日起缴纳国家能源交通重点建设基金，从1989年1月1日起缴纳国家预算调节基金，未缴纳的应予补缴。计征国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金的奖金包括工资总额基数中的奖金和新增效益工资中的奖金（新增效益工资中的奖金根据挂钩第一年工资总额基数中的成本工资和奖金的比例确定）。
　　三、1988年10月1日以后实行挂钩的企业，其在留利中开支的奖金和新增效益工资，均应先按企业的留利总额缴纳国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金后再开支。
　　四、实行挂钩企业的折旧基金和其他预算外资金仍按现行规定缴纳国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金。
　　五、请各省、自治区、直辖市和计划单列市财政厅（局）、国务院各部门于1989年6月底以前，将本地区、本部门经国务院或劳动部、财政部批准实行“总挂总提”奖金进成本的挂钩企业名单报送国家税务局地方税管理司和财政部综合计划司。

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